10051005ns 님의 블로그

1. 서론: 생물 분류의 새로운 도구고대부터 인류는 주변의 동식물을 관찰하고 분류해왔다. 전통적인 생물 분류학은 주로 생물의 외형적 특성, 형태, 해부 구조 등을 바탕으로 생물을 구분했다. 하지만 이러한 방식은 전문가의 경험에 의존하고, 형태가 유사하거나 생활사 주기에 따라 외형이 달라지는 종은 정확한 판별이 어렵다는 단점이 있었다.이를 극복하기 위해 21세기 초에 등장한 기술이 바로 DNA 바코딩(DNA barcoding)이다. 이는 생물의 유전자 서열 중 특정 구간을 표준화하여, 생물 종을 빠르고 정확하게 식별할 수 있도록 하는 기법이다. DNA 바코딩은 분자생물학과 생물분류학의 경계를 허물고, 생물다양성 보전, 생태계 감시, 식품 검증, 불법 야생생물 단속 등 다양한 분야에서 활용되고 있다.이 글에..

1. 서론: 유전자 발현 분석의 진화세포가 특정한 기능을 수행할 수 있는 이유는 유전체 안에 존재하는 수많은 유전자 중 일부가 활성화되기 때문이다. 이 활성화된 유전자는 전사 과정을 거쳐 RNA로 전환되며, 이후 번역되어 단백질을 만들어낸다. 따라서 RNA의 양과 종류를 측정하는 것은 세포 상태, 조직 기능, 질병 발생과 같은 생물학적 현상을 이해하는 핵심 방법 중 하나다.과거에는 마이크로어레이 기술이 주로 사용되었지만, 해상도와 정확도, 유연성에서 한계가 있었다. 이를 극복한 기술이 바로 RNA 시퀀싱(RNA-Seq)이며, 이 방법은 차세대 시퀀싱(Next Generation Sequencing, NGS) 기술을 이용해 전사체 전체의 RNA를 정량적이고 정확하게 분석할 수 있게 한다.본 글에서는 RNA..

1. 서론: 세포 하나, 그 자체가 세계다전통적인 유전체 분석 기술은 수천, 수만 개의 세포로부터 얻은 평균적인 유전자 정보를 제공한다. 그러나 생명 현상은 개별 세포 수준에서 발생하며, 동일한 조직 내의 세포조차도 유전자 발현과 유전체 상태에서 서로 다른 특성을 지니고 있다. 특히 암세포, 줄기세포, 면역세포 등은 개체 간 이질성(heterogeneity)이 매우 높아, 개별 세포 수준에서의 분석이 필요하다.이러한 요구에 따라 등장한 기술이 바로 단일세포 유전체 분석(Single-cell genomics)이다. 이 기술은 단 한 개의 세포에서 DNA, RNA, 단백질, 후성유전체 등의 정보를 정밀하게 추출하고 분석할 수 있게 하며, 생물학 연구와 정밀의료의 혁신을 이끌고 있다.본 글에서는 단일세포 유전..

1. 서론: 유전자를 자르고 바꾸는 기술의 탄생오랫동안 유전자는 ‘건드릴 수 없는 생명의 설계도’로 여겨져 왔다. 하지만 21세기 들어, 우리는 그 유전자를 정밀하게 자르고, 고치고, 새로 삽입하는 일이 가능한 시대에 살고 있다. 이 놀라운 기술의 중심에는 바로 CRISPR-Cas9이 있다. 이 기술은 생명과학의 다양한 분야를 혁신적으로 바꾸었으며, 유전자 치료, 농업, 미생물 개량, 생물학 연구 전반에 지대한 영향을 미치고 있다.CRISPR-Cas9은 세균의 면역 시스템에서 유래한 자연 발생 유전자 절단 시스템으로, 기존의 유전자 편집 기술들보다 훨씬 간단하고 정밀하며 비용도 저렴하다는 점에서 폭발적인 주목을 받고 있다. 본 글에서는 CRISPR-Cas9 기술의 구조와 작동 원리를 비롯해, 다양한 활용..

1. 서론: 유전체 정보는 어디에 저장되어 있을까?21세기 생명과학은 ‘데이터 중심 과학’이라 불린다. DNA 서열 해독 기술의 발전으로 수많은 생물 종의 유전체 정보가 빠른 속도로 축적되고 있으며, 이 방대한 데이터를 체계적으로 저장하고, 접근 가능하게 만든 것이 바로 유전체 데이터베이스이다.과거에는 개별 연구자가 몇 개의 유전자를 분석하던 시대였다면, 이제는 수억 개의 염기쌍 정보를 포함하는 전장 유전체 수준의 분석이 일상이 되었다. 이에 따라 데이터를 저장하고 정리하며, 검색과 분석까지 가능하도록 만든 전문 데이터베이스의 중요성이 날로 커지고 있다. 이 글에서는 연구자와 일반 사용자 모두가 활용할 수 있는 주요 유전체 데이터베이스들을 소개하고, 각 데이터베이스의 목적, 기능, 접근 방법을 자세히 해..

1. 서론: 유전자의 미세한 차이가 만드는 다양성모든 인간은 99.9% 동일한 유전 정보를 가지고 있다. 하지만 나머지 0.1%의 차이가 외모, 성격, 질병 민감도, 약물 반응 등 다양한 특성을 만들어낸다. 이 0.1% 차이를 구성하는 주요 요소 중 하나가 바로 SNP(Single Nucleotide Polymorphism, 단일 염기 다형성)이다.SNP는 유전체상 특정 위치에서 한 개의 염기서열이 다른 개체와 다르게 나타나는 유전적 변이를 말한다. 예를 들어, 어떤 사람은 특정 위치의 DNA 염기서열이 A이고, 다른 사람은 같은 위치에서 G인 경우를 의미한다. 이러한 미세한 차이는 유전적 다양성의 주요 원천이자, 질병 연구와 개인 맞춤 의료의 핵심 정보로 활용된다. 본 글에서는 SNP의 정의, 발견 및..

1. 서론: 유전체 발현 분석의 시대를 열다생명체는 동일한 유전체를 가지고 있지만, 조직의 종류나 환경에 따라 각기 다른 유전자들이 활성화되고 억제된다. 이러한 유전자 발현의 차이는 질병의 발생, 세포의 분화, 생물학적 반응 등 다양한 현상의 원인이 된다. 2000년대 초반까지는 개별 유전자의 발현을 분석하는 데 많은 시간과 노력이 필요했으나, 이후 등장한 마이크로어레이(Microarray) 기술은 이러한 한계를 극복하고, 단일 실험으로 수천 개의 유전자의 발현 상태를 동시에 측정할 수 있게 하였다. 이 기술은 생물학적 시스템을 총체적으로 이해할 수 있도록 해주었고, 유전체 기반 분석의 대중화를 촉진시켰다. 본 글에서는 마이크로어레이의 작동 원리, 실험 절차, 분석 방법, 해석 방식에 대해 심도 있게 살..

1. 서론: 유전체 해독의 패러다임을 바꾸다21세기 생명과학을 지탱하는 가장 핵심 기술 중 하나가 바로 차세대 시퀀싱(Next Generation Sequencing, 이하 NGS)이다. 기존의 Sanger 시퀀싱이 높은 정확도에도 불구하고 느리고 비용이 많이 드는 한계가 있었다면, NGS는 이 문제를 극복하며 짧은 시간 안에, 저렴한 비용으로, 방대한 양의 DNA 또는 RNA 서열을 해독할 수 있게 해주었다. 이 기술은 인간 유전체 해독 이후 등장했으며, 지금은 암 연구, 감염병 진단, 맞춤형 치료, 후성유전체 분석, 메타유전체 분석 등 수많은 분야에서 활용되고 있다. 본 글에서는 NGS의 핵심 작동 원리와 주요 플랫폼, 실험 과정, 응용 분야에 대해 자세히 살펴본다.2. NGS란 무엇인가?NGS는 수..

1. 인간 유전체 프로젝트의 개요인간 유전체 프로젝트(Human Genome Project, HGP)는 인류 역사상 가장 방대한 과학적 도전 중 하나로, 인간의 유전 정보를 구성하는 모든 염기서열을 해독하고 유전자들의 위치 및 기능을 규명하는 것을 목표로 한 대규모 국제 공동 연구 프로젝트였다. 1990년에 공식적으로 시작되어 2003년에 완료된 이 프로젝트는 미국, 영국, 일본, 프랑스, 독일, 중국 등 20여 개국의 협력으로 이루어졌으며, 미국 국립보건원(NIH)과 영국의 웰컴 트러스트(Wellcome Trust)가 중심적인 역할을 수행했다. 프로젝트의 결과로 인간 유전체의 약 99%에 해당하는 30억 개 염기쌍의 염기서열이 정확히 분석되었고, 약 20,000~25,000개의 유전자 정보가 밝혀졌다...